旷工一天扣三天工资的做法可能引发法律风险，以下为您分析并举例说明：
1、公司或面临劳动仲裁败诉，需返还多扣工资。例如，某公司未公示旷工扣三天工资的规章制度，员工旷工一天后公司扣除其三天工资，员工申请仲裁，仲裁委因规章制度未公示认定扣款违法，裁决公司返还多扣工资。
2、公司可能因违法扣款被劳动监察部门处罚。比如，某公司员工月工资4000元，旷工一天被扣600元（三天工资），扣除部分占当月工资15%（未超20%），但公司无法证明员工旷工造成600元经济损失，劳动监察部门接到投诉后，认定公司违法扣款，责令改正并可能处以罚款。
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在处理旷工一天扣三天工资的问题时，员工需避免以下错误操作：
1、不核实规章制度就默认扣款：有些员工收到扣款通知后，未核实公司规章制度是否合法，直接接受扣款，这可能损害自身权益，因为不合法的规章制度导致的扣款行为无效。
2、拒绝说明理由直接对抗：员工旷工后，若有正当理由却不向公司提供相关证明，而是直接对抗，可能让公司更坚持扣款决定，不利于问题解决，有正当理由应及时沟通说明。
3、超过仲裁时效主张权利：劳动争议仲裁时效为一年，从知道或应当知道权利被侵害之日起算。若员工明知扣款违法却超过一年才申请仲裁，可能因时效问题无法通过仲裁维权。若您已出现类似错误操作，建议尽快咨询我，为您提供补救措施。
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关于旷工一天扣三天工资的合法性，可依据《工资支付暂行规定》第十六条分析其法律适用。
《工资支付暂行规定》第十六条明确：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。”
旷工一天扣三天工资本质是从工资中扣除金额。若员工旷工未造成公司经济损失，公司无权扣除工资；若造成损失，扣除金额也不得超过当月工资的20%。例如，员工月工资5000元，旷工一天扣500元（三天工资，约每天167元），500元占10%（未超20%），但公司需证明有500元经济损失且劳动合同有约定赔偿条款，否则扣除无依据。因此，旷工一天扣三天工资通常不合法。
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判断旷工一天扣三天工资是否合法，需结合法律规定和实际情况：
一般而言，这种做法可能涉嫌违法，具体需看公司规章制度是否合法及罚款金额是否超限。
1. 若公司规章制度未经民主程序制定或未向员工公示，旷工扣三天工资的规定因缺乏合法基础而无效。
2. 若规章制度合法制定且已公示，但扣除三天工资导致当月扣除部分超过员工当月工资的20%，则超过部分不合法。
3. 若扣除三天工资后剩余工资低于当地月最低工资标准，公司需按最低工资标准支付，否则违法。
4. 若公司能证明员工旷工一天造成相当于三天工资的经济损失，且劳动合同有明确约定赔偿条款，可要求员工赔偿，但每月扣除仍不得超过当月工资的20%。

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